Представители государства в органах управления ПАО «Транснефть» определяют стратегические направления ее развития и осуществляют контроль производственно-хозяйственной и финансовой деятельности. В Совет директоров компании входят независимые директора, при Совете директоров созданы специализированные комитеты.

Комитет по стратегии, инвестициям и инновациям образован для подготовки рекомендаций и предложений Совету директоров, направленных на повышение эффективности деятельности ПАО «Транснефть», его стратегии на долгосрочную перспективу, а также на определение приоритетов научно-технической и инновационной политики в системе трубопроводного транспорта нефти и нефтепродуктов.

Комитет по аудиту обеспечивает контроль Совета директоров за финансово-хозяйственной деятельностью Компании и предназначен для объективного и независимого информирования членов Совета директоров о финансово-хозяйственном состоянии Компании и оценки эффективности систем внутреннего контроля.

Комитет по кадрам и вознаграждениям осуществляет подготовку предложений и рекомендаций Совету директоров, направленных на повышение эффективности деятельности ПАО «Транснефть» в области кадровой политики, системы оплаты труда и вознаграждений.